Šiuo metu yra vykdomi du projektai, kuriems dalinį finansavimą skyrė Lietuvos Respublikos kultūros ministerija.

Muziejinių vetrybių restauravimo ir prevencinio konservavimo projektui “Lietuvos muzikos patriarcho Juozo Naujalio relikvijų restauravimas” iš Lietuvos Respublikos kultūros ministerijos gauta 3500 litų suma. Už šią sumą bus restauruoti autentiški kompozitoriaus Juozo Naujalio memorialiniai daiktai: Čikagos lietuvių 1922 m. Naujaliui padovanotos sidabrinės vazos-taurės lagamino tipo dėklas ir XX a. pr. medinė spinta, kurią muziejui 2008 m. padovanojo kompozitoriaus anūkė Rasa Laurinaitienė. Relikvijas restauruos Lietuvos dailės muziejaus Prano Gudyno restauravimo centras ir Alytaus kraštotyros muziejaus medžio restauratorius.

Muziejų ekspozicijų atnaujinimo bei pritaikymo vaikams ir jaunimui projektui “Informacinio-edukacinio terminalo įrengimas Lietuvos muzikos patriarcho Juozo Naujalio (1869-1934) ekspozicijoje” iš Lietuvos Respublikos kultūros ministerijos gauta 30000 litų suma. Už šią sumą muziejuje bus įrengtas informacinis-edukacinis terminalas, kuriame bus patalpinta tekstinė, vaizdinė ir audio medžiaga apie kompozitorių Juozą Naujalį.